公司注册地和实际经营地不一致的处理办法:
1、变更工商登记,将公司注册地变更为经营所在地;
2、设立分公司,把经营所在地业务设立分公司;
3、若涉及税收优惠,流转税可在经营地分公司缴纳,所得税由总公司汇算清缴;
4、注册地应有文书信函收发联络人,避免重要的法律文书延误遗失,错过法定期限导致经济法律责任。